这个故事的开始，是在一辆通往秘境学院的列车上，一只红色眼睛的小白兔和一个魔法师的相遇。
这是一只非常怕寂寞的小白兔，她找上了自己在人群之中，一眼就吸引了她的神秘魔法师，向他问出了第一个问题——
“你也是一个人吗？”
魔法师没有回答她的问题，仅仅只是靠在自己体积过于巨大的魔杖之上，翻了一页手中的书。
这仿佛是在用肢体表达自己的回答一样的举动，让小白兔明白了。
啊，他确实是一个人。
魔法师和小白兔一样，都是与其他人格格不入的异类存在，所以不能直视过于巨大物体的人们全都忽略了这一处隔间。
看到这样魔法师，小白兔觉得不能就这样放着他不管。
于是，一个人的魔法师就被小白兔提问了各种问题——
你在看什么书？
你为什么不说话？
那根巨大的木头是你的魔杖吗？
……
最后，被连续的提问托出一个人脑内世界魔法师为了驱逐闯进他的世界的兔子，为她表演了晴日烟花的幻象。
但是，魔法师失策了，小白兔喜欢烟花，并且想要学习烟花的制作方法。
神秘并没有驱逐同样身为异类的兔子，反而让兔子获得了一颗永远不会疲倦的心灵。
在名为好奇的心灵带动下，小白兔在秘境学院的每一天都围在魔法师的身边，向他学习着原本独属于魔法师的智慧与记忆。
有些有用的——幻象与梦境的制作方法、金钱与传统的之间的关系、打发时间的自娱自乐……等等。
有些没有用的——如何消失在别人的视线里、故事和新知识可以代替与别人之间的交流、旧玩具就算交给别人也不许扔掉……等等
也有一些年幼的小白兔听不懂的事情——会动的画面里充满了谎言和美好、已经被人知道的故事不是历史就是命运、在无所不有的世界里能够遇见的事情和自己无关的那一部分占了大多数……等等。
小白兔在魔法师身边学到了各种各样的东西，说了很多很多的话，度过了一段快乐的时光。
但就像魔法师所说的那样，在时间的流逝里，所有事情都是会改变的，只是有些事情变的太慢，你察觉不到，错以为永恒而已。
小白兔一开始也以为自己会永远就这样跟在魔法师的身边。就算是她单方面的提问变成了两个人的互动，两个人在一起的风景也不会变化太多。直到了有一天魔法师从小白兔的身边消失不见了。
小白兔很着急，她拼尽全力，找遍了秘境学院的每一个地方，然后她第一次意识到了一件事——全世界的范围对于自己来说实在是太大了。
失落的小白兔回到了自己长大的家里，但是她却发现陪自己长大的父母并不在那个让她怀念的房子里，然后小白兔又在自己意识到的那件事之后添了一句话，使它变得完整——全世界的范围对于自己来说实在是太大了，但只有熟悉的人身边才是属于她的天地。
年幼的小白兔过早的明白了这个道理，决定就算是一个人也要坚强的活下去。
但是最终，怀念着旧日时光的怕寂寞小白兔，能做的却仅仅只是默默守护着魔法师的遗产和自己长大的房子，等待着熟悉的人回到原来的地方。
终于有一天，稍微长大了一点的小白兔听说魔法师又一次出现了，于是她焦急的站在魔法师的面前，问道：
“你消失的一年里去了哪里？为什么不带我一起？”
但是，亦如既往的魔法师，却是笑道：
“一年吗？但是对于我来说却是昨天啊。”
只是稍微长大了一点的小白兔并不能理解魔法师的微笑，哭着，笑着又一次跟上了魔法师的脚步，错以为只要自己跑的快一些就能和魔法师永远在一起。
在那一刻，魔法师也明白了，自己驯养了那只一直陪在自己身边的兔子，所以他也有责任陪在怕寂寞的兔子身边。
于是，魔法师和小白兔一起离开秘境里的学院，踏上了寻找真实的旅程。
在旅途之中，他们遇见了一群来自不同故事里的迷途者——
有红莲的勇者，有图书馆的管理员，有银钥匙的守门人，有恋爱中的少女，有高洁而迷茫的公主，有电闪雷鸣的中学生，有爱说谎的麻烦鬼，有闪耀纯净的宝石之子，还有寻找救赎的赏金猎人和忏悔过去的守护骑士……
魔法师为迷路的人们搭建了一艘船，既可以寻找回到故乡的路，又可以寻找冒险者的宝藏，船上搭载着迷你的花园和彩虹色的帆，还有各种各样有趣的人……是一艘非常美好的船。
这一次，有了很多伙伴的小白兔非常高兴，她以为这样心潮澎湃的冒险之旅才刚刚开始。
但是，就在这启航的潮汐当中，原本身为掌舵手的魔法师却丢下了船上的一切，独自迷航在了漫无边境的虚空之海里。
第二次的离别，让小白兔看到了一个更加宽广的世界，也让小白兔明白了在魔法师眼里原来自己也是这般渺小。
也让小白兔明白了，如果被驯养了，就要冒着掉眼泪的风险，她是那么想要和跟在魔法师的身边，跟他一起走，但事实是，小白兔醒过来的时候，魔法师就已经消失，就如同昨天晚上的星星一样。
魔法师曾今告诉过小白兔，你看到的我只不过是一具躯壳，哪怕他在你面前消失，那都不是真的。虚空之海的浪太大了，他的漂泊只是会丢失一些行李，这没什么好悲伤的……
又经历了漫长的等待，留在船上的小白兔也开始慢慢的长大，慢慢的变强，强到可以独自一人从浪潮之中守护魔法师的船，守护这一处虚空之海的道标。
漫长的等待之后，约定的那一天魔法师终于在虚空之海中找到了彩虹色的道标，带着他在迷途路上捡来的白猫和松鼠，重新回到了船上。
看到那个陌生而又熟悉的魔法师，带着新的宠物登上了船头