洲杯时的脚伤一直处在修养状态，直到2004年9月28日鲁尼在曼联对阵费内巴切的欧冠小组赛中首次代表曼联出场，而他在曼联的处子秀就上演帽子戏法，帮助曼联六比二大胜对手，这场比赛让鲁尼成为欧冠历史上上演帽子戏法最年轻的球员。2004年10月24日在曼联对阵阿森纳的英超联赛中，鲁尼贡献了一次助攻和一粒进球，帮助曼联二比零击败阿森纳，同时终结了对手四十九场不败的纪录。鲁尼在曼联的首个赛季里各项比赛打进十七球，并在赛季结束时当选pfa年度最佳年轻球员。

    2005-2006赛季在英格兰联盟杯的比赛中，曼联一路闯入决赛，而鲁尼在决赛中打进两粒进球，帮助曼联四比零击败威根竞技，鲁尼获得自己职业生涯中的第一个冠军。2006年4月30日在曼联和切尔西的英超联赛中，鲁尼被切尔西队的后卫保罗·费雷拉侵犯，导致跖骨骨折，最终导致曼联零比三负于切尔西，让切尔西提前两轮成功卫冕英超联赛冠军。而鲁尼在整个赛季共出场四十八次，贡献了十九粒进球，并且在赛季末蝉联pfa年度最佳年轻球员。

    2006-2007赛季在季前热身赛中，鲁尼在对阵波尔图的比赛中因为肘击对方球员科佩勒·费雷拉被裁判红牌罚下。但荷当值主裁判去函英足总要求对鲁尼追加处罚，英足总随后宣布鲁尼停赛三场，成为了世界足坛罕有的因为热身赛而得到追加处罚的案例。2006年8月20日鲁尼在英超联赛首轮表现抢眼，攻入两粒进球而且贡献出两次助攻，帮助曼联五比一大胜富勒姆。2006年10月28日刚过完二十一岁生日的鲁尼在曼联对博尔顿的比赛中上演帽子戏法，结束自己长达十场不进球的进球荒。

    整个2006-2007赛季克里斯蒂亚诺·罗纳尔多成为了曼联的进攻核心，鲁尼处于从属的地位，但依旧有不俗的表现在各项比赛打进二十三球，帮助球队获得该赛季的英超联赛冠军，这也是鲁尼的第一个英超冠军，此外曼联在欧冠也打进四强，鲁尼在对阵罗马的比赛中打破了自己欧冠三年进球荒，并且在对ac米兰的半决赛中打进两粒进球。

    2007-2008赛季鲁尼在该赛季前半段多次受伤，但在2007年10月份复出后的七场比赛攻入七粒进球。整个赛季鲁尼在联赛中仅打进十二粒进球，但以自己的突破和传球支援其他队友，最终帮助曼联获得英超联赛和欧冠的双冠王。

    2008-2009赛季在曼联引进迪米塔·贝尔巴托夫后，鲁尼一度被怀疑要沦为替补，但后来证明他依旧是曼联的核心球员之一。鲁尼在这个赛季的进球率没有提升，仅在英超联赛中打进十二球，但在世俱杯的两场比赛中攻入三球，被评为世俱杯最佳球员。最终鲁尼在这个2008-2009赛季出场四十八次并贡献二十粒进球，帮助曼联完成英超三连冠。